Les chercheurs qui ont cartographié une partie de la propagation d’origine du coronavirus chez l’homme ont découvert qu’il existe des variantes du virus dans le monde.
Ils ont reconstruit les premières voies évolutives de Covid-19 alors que l’infection se propageait de Wuhan, en Chine, en Europe et en Amérique du Nord.
En analysant les 160 premiers génomes viraux complets à séquencer à partir de patients humains, les scientifiques ont découvert que la variante la plus proche de celle découverte chez les chauves-souris était largement trouvée chez des patients des États-Unis et d’Australie, pas de Wuhan.
Le Dr Peter Forster, généticien et auteur principal de l’Université de Cambridge, a déclaré: «Il y a trop de mutations rapides pour tracer soigneusement un arbre généalogique Covid-19.
Nous avons utilisé un algorithme de réseau mathématique pour visualiser simultanément tous les arbres plausibles. «Ces techniques sont principalement connues pour cartographier les mouvements des populations humaines préhistoriques à travers l’ADN. Nous pensons que c’est l’une des premières fois où ils ont été utilisés pour tracer les voies d’infection d’un coronavirus comme Covid-19.
L’équipe a utilisé des données d’échantillons prélevés à travers le monde entre le 24 décembre 2019 et le 4 mars 2020. Ils ont trouvé trois variantes distinctes, mais étroitement liées, de Covid-19, qu’ils ont appelées A, B et C.
Les chercheurs ont découvert que le type de coronavirus le plus proche de celui découvert chez les chauves-souris – type A, le génome d’origine du virus humain – était présent à Wuhan, mais n’était pas le type de virus prédominant de la ville.
Des versions mutées de A ont été observées chez des Américains qui auraient vécu à Wuhan, et un grand nombre de virus de type A ont été découverts chez des patients américains et australiens.
Le principal type de virus de Wuhan était B et était répandu chez les patients de toute l’Asie de l’Est, mais il n’a pas beaucoup voyagé au-delà de la région sans autres mutations.
Les chercheurs disent que la variante C est le principal type européen, trouvé chez les premiers patients de France, d’Italie, de Suède et d’Angleterre.
Camille Legaré